| 要素 | 作用 | 作用于哪个结构域 | 常见异常 |
|---|---|---|---|
| 模板 DNA | 提供序列信息;双链在变性时解开 | — | 浓度过高会增加非特异;过低则 Ct 晚 |
| 引物 | 决定扩增起点与特异性;退火时结合 | 手指域识别引物–模板 | 二聚体会与引物竞争,导致某一重不出 |
| dNTP | 延伸的底物,提供能量与碱基 | 手掌域催化掺入 | 浓度失衡会降低保真度;dUTP 用于 UNG 体系 |
| Mg²⁺ | 中和磷酸骨架、辅助磷酸转移 | 手掌域活性中心 | 过低酶不工作,过高降低特异性 |
| 缓冲 pH | 维持酶构象与活性 | 全酶构象 | 一步法中要同时满足 RT 与 Taq |
| 探针 | 结合靶标后被子解,产生荧光 | 5′→3′ 外切酶域 | 探针降解或二聚会导致假阴性 |
| 聚合酶 | 催化 dNTP 掺入、延伸新链 | 手掌 / 拇指 / 手指 | 耐热性、持续合成、保真度是三个不同维度 |
| UNG / dUTP | 切除尿嘧啶,消除既往产物污染 | UNG 催化域 D64 | 热敏 UNG 需在升温后失活,否则伤及本轮产物 |
让客户说现象(Ct 晚 / 不出峰 / 长片段掉 / 污染),对应到变性、退火、延伸、探针水解、逆转录、RNase H、UNG 七个环节之一。
“您这个问题落在手掌域(催化)还是拇指域(持续合成)”——把酶的黑箱拆成可讨论的部件。
按环节给品类方案,并说明不能承诺的边界(>4 kb 一步法、任意重数多重、常温 12 个月)。
不把“Ct 晚”直接归因于酶活;不在没有阳性对照与复孔数据时下结论;不用预测结构讲精确构象。