蛋白结构与性能关联工作台

Taq / Tth / M-MLV RT / UNG（E. coli）。三维视图可旋转、滚轮缩放、点击残基；颜色与结构域轨道一致。数据：UniProt / PDB / AlphaFold DB / PubMed。截至 2026-10-17。

Taq DNA 聚合酶 P19821 · Thermus aquaticus · 832 aa 实验结构

域聚焦显示侧链只显示关键残基

拖动旋转｜滚轮缩放（可到单残基）｜ 点击残基显示名称与编号

关键事实

UniProt	P19821
长度	832 aa
结构来源	1TAQ
实验解析	10–832
预测补全	无
对齐 RMSD	—
主要用途	PCR / qPCR / 探针法

图例（图形 / 颜色 / 操作）

图形代表什么 螺旋 = α 螺旋箭头 = β 折叠细线 = 无规卷曲

颜色 = 结构域（含功能） 5′→3′ 外切酶域（1–290）：水解探针与损伤碱基，决定 TaqMan 类探针法可用性聚合酶域 · 手指（291–420）：结合模板与 dNTP，决定底物识别聚合酶域 · 手掌（421–610）：催化中心，dNTP 掺入与磷酸二酯键形成聚合酶域 · 拇指（611–832）：结合双链 DNA，决定持续合成能力

标记与操作 红色棒状 = 选中残基 / 催化位点斜纹 = AlphaFold 预测区左键拖动 = 旋转｜滚轮 = 缩放平移模式拖动或右键拖动 = 平移视野点击残基 = 显示名称与编号勾选「域聚焦显示侧链」= 该域叠加棒状侧链

结构域轨道

斜纹＝预测区（AlphaFold），实色＝实验解析区。三维视图与轨道同色系。

序列按结构域着色；深红为催化位点

MRGMLPLFEPKGRVLLVDGHHLAYRTFHALKGLTTSRGEPVQAVYGFAKSLLKALKEDGDAVIVVFDAKAPSFRHEAYGGYKAGRAPTPEDFPRQLALIKELVDLLGLARLEVPGYEADDVLASLAKKAEKEGYEVRILTADKDLYQLLSDRIHVLHPEGYLITPAWLWEKYGLRPDQWADYRALTGDESDNLPGVKGIGEKTARKLLEEWGSLEALLKNLDRLKPAIREKILAHMDDLKLSWDLAKVRTDLPLEVDFAKRREPDRERLRAFLERLEFGSLLHEFGLLESPKALEEAPWPPPEGAFVGFVLSRKEPMWADLLALAAARGGRVHRAPEPYKALRDLKEARGLLAKDLSVLALREGLGLPPGDDPMLLAYLLDPSNTTPEGVARRYGGEWTEEAGERAALSERLFANLWGRLEGEERLLWLYREVERPLSAVLAHMEATGVRLDVAYLRALSLEVAEEIARLEAEVFRLAGHPFNLNSRDQLERVLFDELGLPAIGKTEKTGKRSTSAAVLEALREAHPIVEKILQYRELTKLKSTYIDPLPDLIHPRTGRLHTRFNQTATATGRLSSSDPNLQNIPVRTPLGQRIRRAFIAEEGWLLVALDYSQIELRVLAHLSGDENLIRVFQEGRDIHTETASWMFGVPREAVDPLMRRAAKTINFGVLYGMSAHRLSQELAIPYEEAQAFIERYFQSFPKVRAWIEKTLEEGRRRGYVETLFGRRRYVPDLEARVKSVREAAERMAFNMPVQGTAADLMKLAMVKLFPRLEEMGARMLLQVHDELVLEAPKERAEAVARLAKEVMEGVYPLAVPLEVEVGIGEDWLSAKE

结构域 ↔ 性能关联每条附 PMID

关联论断	结构域	PMID	证据强度	文献标题
5′→3′ 外切酶活性可水解探针，是 TaqMan 类实时荧光 PCR 的酶学基础	5′→3′ 外切酶域	10510675	直接	Real-time 5'-->3' exonuclease-based PCR assay for detection of the t(11;14)(q13;
F667Y 突变使 Taq 能掺入 ddNTP，成为 Sanger 测序用酶（AmpliTaq FS）	聚合酶域 · 手掌	8891223	直接	AmpliTaq DNA polymerase, FS dye-terminator sequencing: analysis of peak height p

“直接”＝文献结论直接支持该论断；未读原文或间接推断的条目不收录。

Tth DNA 聚合酶 P52028 · Thermus thermophilus · 834 aa 预测模型

域聚焦显示侧链

拖动旋转｜滚轮缩放（可到单残基）｜ 点击残基显示名称与编号

关键事实

UniProt	P52028
长度	834 aa
结构来源	AlphaFold
实验解析	296–832
预测补全	是（pLDDT 91.56）
对齐 RMSD	1.86 Å
主要用途	RT-PCR / 单管扩增

图例（图形 / 颜色 / 操作）

图形代表什么 螺旋 = α 螺旋箭头 = β 折叠细线 = 无规卷曲

颜色 = 结构域（含功能） 5′→3′ 外切酶域（1–290）：切探针/去损伤；该区段无实验结构聚合酶域 · 手指（291–420）：结合模板与 dNTP聚合酶域 · 手掌（421–610）：催化中心聚合酶域 · 拇指（611–834）：持续合成

结构域轨道

斜纹＝预测区（AlphaFold），实色＝实验解析区。三维视图与轨道同色系。

序列按结构域着色；深红为催化位点

MEAMLPLFEPKGRVLLVDGHHLAYRTFFALKGLTTSRGEPVQAVYGFAKSLLKALKEDGYKAVFVVFDAKAPSFRHEAYEAYKAGRAPTPEDFPRQLALIKELVDLLGFTRLEVPGYEADDVLATLAKKAEKEGYEVRILTADRDLYQLVSDRVAVLHPEGHLITPEWLWEKYGLRPEQWVDFRALVGDPSDNLPGVKGIGEKTALKLLKEWGSLENLLKNLDRVKPENVREKIKAHLEDLRLSLELSRVRTDLPLEVDLAQGREPDREGLRAFLERLEFGSLLHEFGLLEAPAPLEEAPWPPPEGAFVGFVLSRPEPMWAELKALAACRDGRVHRAADPLAGLKDLKEVRGLLAKDLAVLASREGLDLVPGDDPMLLAYLLDPSNTTPEGVARRYGGEWTEDAAHRALLSERLHRNLLKRLEGEEKLLWLYHEVEKPLSRVLAHMEATGVRLDVAYLQALSLELAEEIRRLEEEVFRLAGHPFNLNSRDQLERVLFDELRLPALGKTQKTGKRSTSAAVLEALREAHPIVEKILQHRELTKLKNTYVDPLPSLVHPRTGRLHTRFNQTATATGRLSSSDPNLQNIPVRTPLGQRIRRAFVAEAGWALVALDYSQIELRVLAHLSGDENLIRVFQEGKDIHTQTASWMFGVPPEAVDPLMRRAAKTVNFGVLYGMSAHRLSQELAIPYEEAVAFIERYFQSFPKVRAWIEKTLEEGRKRGYVETLFGRRRYVPDLNARVKSVREAAERMAFNMPVQGTAADLMKLAMVKLFPRLREMGARMLLQVHDELLLEAPQARAEEVAALAKEAMEKAYPLAVPLEVEVGMGEDWLSAKG

结构域 ↔ 性能关联每条附 PMID

关联论断	结构域	PMID	证据强度	文献标题
Mn²⁺ 条件下 Tth 聚合酶具有高效逆转录活性，可在一个管内完成逆转录 + 扩增	聚合酶域	1714296	直接	Reverse transcription and DNA amplification by a Thermus thermophilus DNA polyme

“直接”＝文献结论直接支持该论断；未读原文或间接推断的条目不收录。

M-MLV 逆转录酶 P03355 · Moloney murine leukemia virus · 1738 aa 预测模型

域聚焦显示侧链

拖动旋转｜滚轮缩放（可到单残基）｜ 点击残基显示名称与编号

关键事实

UniProt	P03355
长度	1738 aa
结构来源	AlphaFold
实验解析	24–487
预测补全	是（pLDDT 87.65）
对齐 RMSD	1.45 Å
主要用途	cDNA 合成 / RT-qPCR

图例（图形 / 颜色 / 操作）

图形代表什么 螺旋 = α 螺旋箭头 = β 折叠细线 = 无规卷曲

颜色 = 结构域（含功能） RT 域 · fingers/palm/thumb（741–1100）：逆转录催化：以 RNA 为模板合成 cDNA连接区（1101–1173）：连接 RT 与 RNase H，影响构象协调RNase H 域（1174–1320）：降解 RNA–DNA 杂交链中的 RNA，影响 cDNA 长度

结构域轨道

斜纹＝预测区（AlphaFold），实色＝实验解析区。三维视图与轨道同色系。

序列按结构域着色；深红为催化位点

LAVRQAPLIIPLKATSTPVSIKQYPMSQEARLGIKPHIQRLLDQGILVPCQSPWNTPLLPVKKPGTNDYRPVQDLREVNKRVEDIHPTVPNPYNLLSGLPPSHQWYTVLDLKDAFFCLRLHPTSQPLFAFEWRDPEMGISGQLTWTRLPQGFKNSPTLFDEALHRDLADFRIQHPDLILLQYVDDLLLAATSELDCQQGTRALLQTLGNLGYRASAKKAQICQKQVKYLGYLLKEGQRWLTEARKETVMGQPTPKTPRQLREFLGTAGFCRLWIPGFAEMAAPLYPLTKTGTLFNWGPDQQKAYQEIKQALLTAPALGLPDLTKPFELFVDEKQGYAKGVLTQKLGPWRRPVAYLSKKLDPVAAGWPPCLRMVAAIAVLTKDAGKLTMGQPLVILAPHAVEALVKQPPDRWLSNARMTHYQALLLDTDRVQFGPVVALNPATLLPLPEEGLQHNCLDILAEAHGTRPDLTDQPLPDADHTWYTDGSSLLQEGQRKAGAAVTTETEVIWAKALPAGTSAQRAELIALTQALKMAEGKKLNVYTDSRYAFATAHIHGEIYRRRGLLTSEGKEIKNKDEILALLKALFLPKRLSIIHCPGHQKGHSAEARGNRMADQAARKAAITETPDTSTLLIENSSPYTSE

结构域 ↔ 性能关联每条附 PMID

关联论断	结构域	PMID	证据强度	文献标题
M-MLV RT 由 fingers / palm / thumb / connection 四个亚域加一个 RNase H 域组成	RT 域	25959458	直接	Preparation and characterization of the RNase H domain of Moloney murine leukemi
RNase H 域突变会改变 DNA 合成与链转移行为	RNase H 域	7539510	直接	Effects on DNA synthesis and translocation caused by mutations in the RNase H do
RNase H 域不同突变对 RNase H 活性的影响存在差异	RNase H 域	8576137	直接	Differential effects of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase muta

“直接”＝文献结论直接支持该论断；未读原文或间接推断的条目不收录。

尿嘧啶-DNA 糖苷酶（UNG） P12295 · Escherichia coli K-12 · 229 aa 实验结构

域聚焦显示侧链只显示关键残基

拖动旋转｜滚轮缩放（可到单残基）｜ 点击残基显示名称与编号

关键事实

UniProt	P12295
长度	229 aa
结构来源	3UF7
实验解析	3–225
预测补全	无
对齐 RMSD	—
主要用途	防污染（dUTP/UNG 体系）

催化位点：D64（质子受体（催化））

图例（图形 / 颜色 / 操作）

图形代表什么 螺旋 = α 螺旋箭头 = β 折叠细线 = 无规卷曲

颜色 = 结构域（含功能） UDG 催化域（1–229）：切除 DNA 中的尿嘧啶，防遗留污染

结构域轨道

斜纹＝预测区（AlphaFold），实色＝实验解析区。三维视图与轨道同色系。

序列按结构域着色；深红为催化位点

MANELTWHDVLAEEKQQPYFLNTLQTVASERQSGVTIYPPQKDVFNAFRFTELGDVKVVILGQDPYHGPGQAHGLAFSVRPGIAIPPSLLNMYKELENTIPGFTRPNHGYLESWARQGVLLLNTVLTVRAGQAHSHASLGWETFTDKVISLINQHREGVVFLLWGSHAQKKGAIIDKQRHHVLKAPHPSPLSAHRGFFGCNHFVLANQWLEQRGETPIDWMPVLPAESE

结构域 ↔ 性能关联每条附 PMID

关联论断	结构域	PMID	证据强度	文献标题
UNG 用于去除 PCR 遗留污染（carryover contamination）	UDG 催化域	33469645	直接	Simultaneous detection of Streptococcuspneumoniae and prevention of carryover co
热不稳定 UNG 设计可降低对后续扩增的干扰、减少假阴性	UDG 催化域	35183522	直接	Computational design of a thermolabile uracil-DNA glycosylase of Escherichia col
大西洋鳕 UNG 为冷适应酶，最适反应温度低于人源 UNG	UDG 催化域	11126771	直接	Purification and characterization of a cold-adapted uracil-DNA glycosylase from
冷适应 UNG 的热展开研究支持其“低温高活、升温失活”的特性	UDG 催化域	21959147	直接	Thermal unfolding studies of cold adapted uracil-DNA N-glycosylase (UNG) from At

“直接”＝文献结论直接支持该论断；未读原文或间接推断的条目不收录。

口径与来源

数据源

UniProt：P19821（Taq）、P52028（Tth）、P03355（M-MLV Gag-Pol）、P12295（E. coli UNG）
实验结构：1TAQ（Taq）、8XK9（Tth）、4MH8（M-MLV）、3UF7（UNG）
三维视图：Taq/UNG 用实验结构；Tth/MMLV 用 AlphaFold 模型（实验结构覆盖不全）
文献：PubMed，逐条列 PMID

必须知道的 3 个限制

预测模型不是实验结构：Tth/MMLV 的三维视图来自 AlphaFold，只能示意。
Tth 外切域无实验结构：8XK9 只解析到 296 位。
结构域边界为文献近似：手指/手掌/拇指边界不同文献略有差异。

蛋白结构与性能关联工作台

Taq DNA 聚合酶 P19821 · Thermus aquaticus · 832 aa 实验结构

关键事实

图例（图形 / 颜色 / 操作）

结构域轨道

序列 按结构域着色；深红为催化位点

结构域 ↔ 性能关联 每条附 PMID

Tth DNA 聚合酶 P52028 · Thermus thermophilus · 834 aa 预测模型

关键事实

图例（图形 / 颜色 / 操作）

结构域轨道

序列 按结构域着色；深红为催化位点

结构域 ↔ 性能关联 每条附 PMID

M-MLV 逆转录酶 P03355 · Moloney murine leukemia virus · 1738 aa 预测模型

关键事实

图例（图形 / 颜色 / 操作）

结构域轨道

序列 按结构域着色；深红为催化位点

结构域 ↔ 性能关联 每条附 PMID

尿嘧啶-DNA 糖苷酶（UNG） P12295 · Escherichia coli K-12 · 229 aa 实验结构

关键事实

图例（图形 / 颜色 / 操作）

结构域轨道

序列 按结构域着色；深红为催化位点

结构域 ↔ 性能关联 每条附 PMID

口径与来源

数据源

必须知道的 3 个限制

序列按结构域着色；深红为催化位点

结构域 ↔ 性能关联每条附 PMID

序列按结构域着色；深红为催化位点

结构域 ↔ 性能关联每条附 PMID

序列按结构域着色；深红为催化位点

结构域 ↔ 性能关联每条附 PMID

序列按结构域着色；深红为催化位点

结构域 ↔ 性能关联每条附 PMID