# 科研与蛋白工作台 · 归档

归档日期：2026-10-17
来源目录：`~/Desktop/Hermes输出-工作类/`

## 一、交付物

| 文件 | 说明 |
|---|---|
| `交付物/蛋白结构与性能工作台.html` | 4 个蛋白（Taq/Tth/MMLV/UNG），内嵌 3Dmol，可旋转/缩放/按残基定位；结构域着色；10 条 PMID 关联 |
| `交付物/销售场景手册_PCR机理与Top5_2026-10-17.html` | 独立自包含 45 KB：PCR 机理 + Top5 场景卡 + 对话演练 + 自测 10 题 |
| `交付物/蛋白结构图/*.png` | PyMOL 渲染图（Taq/Tth/MMLV/UNG） |

## 二、数据（可复现）

- UniProt：P19821 / P52028 / P03355 / P12295（序列、结构域、活性位点）
- 实验结构：1TAQ / 8XK9 / 4MH8 / 3UF7
- 预测模型：AlphaFold（MMLV 661–1331 pLDDT 87.65；Tth 1–834 pLDDT 91.56）
- 文献：`数据/蛋白结构/_pmid_abstracts.json`（12 篇摘要）

## 三、重建步骤

```bash
python3 脚本/build_protein_data.py      # 抓 UniProt + PDB 列表
python3 脚本/render_proteins.py         # PyMOL 出图（实验结构）
python3 脚本/render_overlay.py Tth P52028 8XK9_conv.pdb   # 预测+实验叠加
python3 脚本/build_protein_workbench_v2.py   # 生成 3D 工作台
python3 脚本/build_sales_handbook.py    # 生成销售场景手册
```

## 四、必须知道的限制

1. Tth 的 5′→3′ 外切域在实验结构中无序，1–295 为 AlphaFold 预测；
2. MMLV 的 RNase H 域为预测，4MH8 只覆盖到 487 位；
3. 结构域边界为文献近似，不同文献略有差异；
4. 销售场景频次来自宝锐活动/客诉记录，不是行业报告。

## 五、文件清单

| 路径 | 数量 | 大小 |
|---|---|---|
| `交付物/蛋白结构与性能工作台.html` | 1 个文件 | 2872 KB |
| `交付物/销售场景手册_PCR机理与Top5_2026-10-17.html` | 1 个文件 | 45 KB |
| `交付物/蛋白结构图/` | 8 个文件 | 2714 KB |
| `数据/蛋白结构/` | 31 个文件 | 10132 KB |
| `脚本/build_protein_data.py` | 1 个文件 | 5 KB |
| `脚本/render_proteins.py` | 1 个文件 | 3 KB |
| `脚本/render_overlay.py` | 1 个文件 | 2 KB |
| `脚本/render_mmlv_af.py` | 1 个文件 | 1 KB |
| `脚本/build_protein_workbench.py` | 1 个文件 | 15 KB |
| `脚本/build_protein_workbench_v2.py` | 1 个文件 | 18 KB |
| `脚本/add_sales_tab.py` | 1 个文件 | 15 KB |
| `脚本/build_sales_handbook.py` | 1 个文件 | 18 KB |
| `脚本/install_pymol.sh` | 1 个文件 | 1 KB |
| `脚本/pml/` | 2 个文件 | 1 KB |

**合计 15.5 MB**